Vidéo-microscopie sur cellules vivantes : de l'optimisation des conditions d'acquisition à l'analyse du film

Description du poste

Objectifs

A l'issue de la formation, le stagiaire sera capable de :
- Placer les cellules dans des conditions physiologiques pendant l'observation
- Comprendre les principes de base en microscopie en lumière transmise et à fluorescence.
- Savoir sélectionner une sonde fluorescente adaptée à sa question
- Définir et régler de manière optimale les conditions d'acquisition en fonction des phénomènes à observer
- Réaliser un film en 2 ou 3 dimensions
- Améliorer la netteté d'un film 3D en utilisant la déconvolution
- Réaliser des analyses simples (intensité de signal, vitesse de déplacement, tracking automatique d'objets).

Personnes concernées

Chercheurs, ingénieurs, biologistes, techniciens désirant s'initier ou approfondir leurs connaissances pour réaliser des acquisitions en microscopie 2D ou 3D résolue en temps dans le but de mesurer des dynamiques cellulaires et intracellulaires.

Programme

Premier jour :
Matin : Principes théoriques : Vitesses et tailles des objets dans la cellule. Principes de base en microscopie à lumière transmise et à épifluorescence (rappels en microscopie et imagerie conventionnelle, contraste de phase, DIC, fond noir...). Contraintes de l'imagerie du vivant.
Après midi : Applications pratiques : Optimisation des réglages et calibration d'un microscope (règle micrométrique, stabilité, homogénéité, utilisation de billes auto-fluorescentes). Saisie de films 2D sur plusieurs types d'échantillons (mitose, migration cellulaire, trafic membranaire...).
Deuxième jour :
Matin : Différentes sondes fluorescentes. Différents types de microscopie à fluorescence et exemples d'applications (time laps, 3D, speckle, multi-positionnement).
Après midi : Applications pratiques : Saisie de films 2D et 3D sur plusieurs types d'échantillons. Exporter et analyser ces films par Image J et MetaMorph, amélioration de la netteté par déconvolution.

Méthodes pédagogiques

La formation est fondée sur une alternance de cours théoriques et de travaux pratiques sur instruments. Le contenu de la formation pourra être, dans la mesure du possible, adapté à des demandes particulières (contacter les responsables scientifiques).

Nature et sanction de la formation

Cette formation constitue une action d'adaptation et de développement des compétences.

Elle donne lieu à la délivrance d'une attestation de participation.

Une évaluation en fin de formation permet de mesurer la satisfaction des stagiaires ainsi que l'atteinte des objectifs de formation (connaissances, compétences, adhésion, confiance) selon les niveaux 1 et 2 du modèle d'évaluation de l'efficacité des formations Kirkpatrick.

Responsables scientifiques

Dr. Denis Dujardin, Maître de Conférences à l'Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg

Courriel : denis.dujardin@unistra.fr

Pr. Jan De Mey, Professeur à l'Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg

Courriel : jan.de-mey@unistra.fr

Durée
2 jours

Lieu

Faculté de Pharmacie
74, route du Rhin
67401 ILLKIRCH GRAFFENSTADEN
FRANCE

Frais de participation

Repas de midi pris en charge par les organisateurs.
Nombre de participants limité à 8
code : 3072

1030.00
dans le cadre d'un parcours Pass'Compétences.