Maîtriser ImageJ pour le traitement des images numériques

Posté le 05 septembre 2016 par Université de Strasbourg

STRASBOURG, 67 - Bas-Rhin, Alsace
Cette offre d'emploi n'est plus d'actualité.

Les offres d'emploi du secteur Formation - Ecole - Enseignement sur la région Alsace

Description du poste

Objectifs

A l'issue du stage, les participants seront capables d'utiliser les fonctionnalités avancées d'extension d'ImageJ pour développer des fonctions de traitement et d'analyse d'images originales et personnalisées.

niveau 2

Personnes concernées

Chercheurs, ingénieurs et techniciens utilisateurs de l'imagerie numérique, dans tous les domaines, biologie, médecine, astronomie, physique, géosciences etc.

Pré-requis

Connaissances de base en traitement d'image. Utiliser ImageJ ou un autre logiciel de traitement d'images.
Le langage macro d'ImageJ est un langage de programmation, mais il reste très simple.

Programme

Brefs rappels sur ImageJ, un logiciel libre, gratuit et extensible
- Installation sur les différentes plateformes Mac OS X, Windows, Unix.
- Fonctionnement de l'interface graphique
Les deux modalités d'extension du logiciel
- Les macro-commandes (macros)
- Les modules d'extension (plugins)
Le langage macro
- Enregistrement et édition de macros
- Variables et opérateurs
- Traitements conditionnels et structures de contrôle
- Fonctions spécifiques des macro-commandes
- Interaction avec l'utilisateur
- Accès au système de fichiers
- Communication entre macros et de macros à plugins
Autres méthodes d'extension
- Principes de développement de plugins
- Utilisation d'ImageJ comme bibliothèque de fonctions
Personnalisation de l'interface
- Les macros-outils
- Ajout de commandes dans les menus
- Ajout de raccourcis clavier
- Barres de boutons personnalisées
- Création de mini-applications dédiées à base d'ImageJ

Méthodes pédagogiques

Bref diaporama d'introduction, puis prise en main directe du logiciel pour son installation, son utilisation de base, son extension par macro-commandes (macros) et/ou modules d'extension (plugins). Chaque stagiaire dispose d'un poste de travail, de documents papiers et d'un support électronique. Le groupe pourra essayer de mener à bien un ou plusieurs projets concrets proposés par le tuteur ou les stagiaires.

Nature et sanction de la formation

Cette formation constitue une action d'adaptation et de développement des compétences. Elle donne lieu à la délivrance d'une attestation de participation.

Une évaluation en fin de formation permet de mesurer la satisfaction des stagiaires, notamment concernant l'atteinte des objectifs pédagogiques.

Responsable scientifique

Jérôme MUTTERER, Ingénieur de recherche CNRS, Plateforme d'imagerie cellulaire, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, Strasbourg.

Courriel : mutterer@unistra.fr

Durée
2 jours

Lieu


Maison Interuniverisitaire des sciences de l'Homme - Alsace
5 Allée du Généal Rouvillois
67083 STRASBOURG
FRANCE

Frais de participation

Repas de midi pris en charge par les organisateurs.
Code : 296

825.00

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Informations complémentaires

Secteur
Formation - Ecole - Enseignement
Localisation
STRASBOURG, 67 Bas-Rhin, Alsace
Type de contrat
Salaire
Niveau de qualification
Expériences souhaitées

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